Согласно рейтингу регионального оператора АО «Югра–Экология», Нефтеюганский район является одним из самых экологически ответственных в регионе.

Как сообщает официальный сайт Нефтеюганского района ХМАО, Югра участвует в реализации 7 из 11 федеральных проектов в рамках национального проекта «Экология». Так с 1 января 2019 года Ханты-Мансийский автономный округ перешел на новую систему обращения с отходами. Территориальной схемой регион разделен на 2 зоны деятельности: «Южную» и «Северную».

В настоящий момент, рамках регионального проекта «Формирование комплексной системы обращения с твёрдыми коммунальными отходами» национального проекта «Экология» в Нефтеюганском районе ведется строительство комплексного полигона мощностью 90 тыс. тонн/год, предназначенного для городов Нефтеюганск, Пыть-Ях и поселений Нефтеюганского района. На полигонах будет применяться самое современное оборудование для качественной сортировки мусора.